12岁少年强奸了妹妹后主动报案，这种情况该怎么判？

在这种情况下，12岁少年不会被判处刑罚。

首先，刑事责任年龄是判断一个人是否需要对犯罪行为承担刑事责任的重要依据。根据《中华人民共和国刑法》第十七条规定，已满十六周岁的人犯罪，应当负刑事责任。已满十四周岁不满十六周岁的人，犯故意杀人、故意伤害致人重伤或者死亡、强奸、抢劫、贩卖毒品、放火、爆炸、投放危险物质罪的，应当负刑事责任。而已满十二周岁不满十四周岁的人，犯故意杀人、故意伤害致人死亡，或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾，情节恶劣，经最高人民检察院核准追诉的，应当负刑事责任。12岁少年未达到强奸罪的刑事责任年龄，即使实施了强奸行为，也无需承担刑事责任，这是因为考虑到这个年龄段的少年认知能力有限，可能无法完全理解自己行为的严重后果。

其次，虽然少年不承担刑事责任，但并不意味着此事就没有其他处理方式。一方面，其家长或监护人应该对受害者予以相应的民事赔偿，承担起监护不力的责任。另一方面，可能会被要求对该少年进行约束与管理。在必要的时候，还可以依法将其送至特定机构接受特殊矫治教育，帮助其认识到行为的错误，引导其健康成长。