夫妻分居后儿子离婚法院会怎么判？

在夫妻分居后离婚涉及儿子抚养权判决的问题上，法律是有明确规定的。首先要明确，父母与子女间的关系，不会因为父母离婚就消除。离婚后，子女不管是由父还是母直接抚养，依旧是父母双方的子女，父母对子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

对于抚养权归属，不同年龄段有不同考量。如果儿子不满两周岁，一般是以由母亲直接抚养为原则。不过存在特殊情况，要是母亲有不利于抚养子女的情形，比如患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活；或者有抚养条件却不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活等，儿子也可能判给父亲。

当儿子已满两周岁，父母双方就抚养权事项无法协商一致时，法院会根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。比如一方已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力；子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利；无其他子女，而另一方有其他子女等，这些情况会在判决时被优先考虑。

要是儿子年满八周岁，法院必须充分考虑和尊重他自己的主观意愿，看他愿意跟随哪一方生活 。

此外，如果在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，法院也会准许。

法律依据是《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条：父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。

相关概念：

最有利于未成年子女原则：就是在处理子女抚养问题时，法院要全方位考虑各种因素，做出对孩子成长、生活、教育等各方面最有利的决定 。

抚养权：是指父母对其子女的一项人身权利，拥有该权利的一方或双方，在子女成年之前，有权决定是否与子女共同生活，该权利在子女成年时即消灭 。