在房屋合同纠纷案件中，凭双方之间的约定房屋能否直接过户？

在房屋合同纠纷案件中，能否凭双方约定直接过户房屋，需要根据具体情况判断。

首先，若房屋因争议问题被设定了抵押登记或是遭到司法机关的查封，这种情况下是无法进行过户手续的。这是因为房屋的产权状态受到了限制，为了保障抵押权人或司法程序的顺利进行，防止产权出现混乱，法律不允许在此种情况下随意过户。依据《城市房地产转让管理规定》第六条，存在特定限制情形的房地产不得转让。

其次，倘若房屋虽然存在争议，却未因争议问题而受到抵押登记或法院查封等形式的限制，且出让方是房产证所记载的合法权益人，那么在满足相关法律规定的条件下，是可以依法完成过户手续的。比如，双方的约定需明确表达各自意愿，且不违反法律法规和合同基本要素，即双方应当具备相应的民事行为能力，约定是真实的意思表示，内容不违反法律强制性规定等。

另外，需要注意的是，房屋过户需办理不动产登记。房屋买卖合同仅是交易双方的法律行为，合同本身不能直接导致房屋产权的转移，只有经过不动产登记，才能在法律上完成房屋所有权的变更。