实习期内违章两个6分，处理了一个，还有一个第二年扣可以吗？

这种情况需要分驾驶证类型来看。

对于C级驾驶证而言，是可以的。驾驶员驾照在实习期内允许受到扣分之惩罚，只要确保在一个计分周期内累计分数未达到12分，就能继续正常驾驶。计分周期从获得驾驶证的那一天开始计算。驾驶证实习期内违章了只要及时处理违章，缴纳罚款，等记分周期结束的时候，记分自然会被清零，不会影响实习期的转正。

但对于持有B级驾驶证的新手司机来说，不可以第二年再扣。虽然同样可以接受扣分处罚，但是不可被扣除的分数上限为6分。

根据相关规定，当驾驶员累计记分达到规定的最高分值时，相关的交通管理部门将会暂扣其机动车驾驶证，同时对其进行道路交通安全法律、法规方面的教育，并要求其重新参加考试。