有成本但进行了零申报该怎么办？

首先，我们来解释一下“零申报”。零申报是指在纳税申报所属期内，企业没有发生应税收入，同时也没有应纳税额的情况，这时可以进行零申报。简单来说，就是企业在这个时间段内没有赚钱，也不用向税务机关交税。

不过，如果企业有成本支出，这通常意味着企业有一定的经营活动，可能会有对应的收入，正常情况下是不应该进行零申报的。因为成本的产生往往伴随着经济业务的发生，有业务就可能有收入。

依据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十四条规定，纳税人、扣缴义务人编造虚假计税依据的，由税务机关责令限期改正，并处五万元以下的罚款。所以，有成本却零申报的行为可能会被认定为编造虚假计税依据。

要是你已经进行了有成本的零申报，建议你尽快采取措施进行纠正。具体步骤如下：

第一步，自查自纠。仔细核对公司的账目，确定成本支出的具体情况以及是否存在对应的收入。明确哪些业务产生了成本，这些业务是否有相应的收入没有申报。

第二步，主动联系税务机关。向税务机关说明情况，承认错误，并咨询正确的处理方式。一般情况下，税务机关会要求你重新进行纳税申报。

第三步，重新申报。按照正确的收入和成本情况，填写纳税申报表，补缴相应的税款和滞纳金。滞纳金是从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五。

最后，为了避免类似情况再次发生，企业要建立健全的财务管理制度，准确记录每一笔经济业务，按时、如实进行纳税申报。这样不仅可以避免税务风险，也有助于企业的健康发展。