为什么两个子女只扣一个的税？

在个人所得税专项附加扣除中，子女教育扣除是一项重要的内容。子女教育专项附加扣除，指的是纳税人的子女接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。这里所说的全日制学历教育，包括义务教育（小学、初中教育）、高中阶段教育（普通高中、中等职业、技工教育)、高等教育（大学专科、大学本科、硕士研究生、博士研究生教育）。

从政策规定上来说，如果您有两个子女，是可以按照每个子女每月1000元，也就是每月总共2000元的标准进行扣除的。依据《个人所得税专项附加扣除暂行办法》第五条规定，纳税人的子女接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。父母可以选择由其中一方按扣除标准的100%扣除，也可以选择由双方分别按扣除标准的50%扣除，具体扣除方式在一个纳税年度内不能变更。

您只扣除了一个子女的税，可能存在以下几种情况。一是申报信息填写有误，比如只填写了一个子女的相关信息。这种情况下，您可以登录个人所得税APP，检查并修改子女信息，确保两个子女的信息都准确录入。二是扣除方式选择问题，如果您和配偶选择的扣除方式不合理，可能也会出现这种情况。您需要和配偶协商好扣除方式，并且按照规定在APP上进行正确的选择和设置。三是税务系统可能存在信息更新不及时的情况，您可以联系当地税务机关，咨询具体情况，他们会协助您解决问题。