船员证书被海事扣了该怎么处理？

当船员证书被海事部门扣留时，首先要了解海事部门扣证的原因。一般来说，扣证往往是因为船员违反了相关的海上交通安全管理规定、船员管理规定等。

根据《中华人民共和国船员条例》，海事管理机构在实施监督检查时，发现船员存在违反本条例规定行为的，可以对船员进行调查或者检查，情节严重的，可暂扣船员适任证书。所以当证书被扣留时，要积极配合海事部门的调查，如实提供相关的情况和证据。

如果对扣证决定有异议，船员可以申请行政复议或者提起行政诉讼。依据《中华人民共和国行政复议法》和《中华人民共和国行政诉讼法》，船员认为海事部门的扣证行为侵犯其合法权益的，自知道该具体行政行为之日起六十日内可以提出行政复议申请；不服复议决定的，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起诉讼；也可以直接向人民法院提起诉讼，但应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。

在接受调查和处理期间，船员要严格遵守海事部门的要求。若经过调查，确实存在违规行为，要按照海事部门的处罚决定，及时改正错误，接受相应的处罚，比如缴纳罚款、参加培训等。完成处罚要求后，按照规定的程序申请发还证书。