民事纠纷中被告公司已经注销了该怎么办？

在民事纠纷里，如果遇到被告公司已经注销的情况，处理方式要依据具体情形来确定。首先，我们得明白公司注销意味着什么。公司注销是指当一个公司宣告破产，被其它公司收购、规定的营业期限届满不续、或公司内部解散等情形时，公司需要到登记机关申请注销，终止公司法人资格的过程。一旦公司注销，其法人资格就不存在了，正常情况下不能再作为诉讼主体参与民事纠纷。

依据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条规定，企业法人解散的，依法清算并注销前，以该企业法人为当事人；未依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人。所以，如果公司是依法清算后注销的，在清算过程中，公司应该处理了债权债务问题。要是在清算时没有将你涉及的债权进行处理，而你又有证据证明该债权的存在，那么你可以查看清算报告等文件，看是否存在清算组成员未依法履行通知和公告义务等过错行为。若存在，你可以依据《中华人民共和国公司法》第一百八十九条规定，清算组成员因故意或者重大过失给公司或者债权人造成损失的，应当承担赔偿责任，向清算组成员主张赔偿。

如果公司未依法清算就被注销，此时可以将该企业法人的股东、发起人或者出资人列为被告。因为他们没有按照法律规定对公司进行清算，损害了债权人的利益，根据上述民事诉讼法解释，他们要对公司的债务承担责任。你可以通过收集相关证据，证明你与原公司之间存在民事纠纷以及债权债务关系，然后向法院申请变更被告，将股东、发起人或者出资人列为新的被告继续进行诉讼。

在实际操作中，你要及时向法院说明被告公司已注销的情况，并按照法院的要求提供相关证据材料。同时，注意收集与原公司交易的合同、票据、往来函件等证据，以便更好地维护自己的合法权益。总之，即使被告公司注销，只要你能找到合适的责任承担主体，并提供充分的证据，你的合法权益依然有可能得到法律的保护。