申请人在道路上学驾驶时未按照第三十九条规定会怎样？

首先，我们得明确这里所说的第三十九条一般指的是《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第三十九条。该条规定：人行横道信号灯表示： （一）绿灯亮时，准许行人通过人行横道；（二）红灯亮时，禁止行人进入人行横道，但是已经进入人行横道的，可以继续通过或者在道路中心线处停留等候。不过申请人在道路上学驾驶相关的规定主要是在《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第二十条。

《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第二十条明确规定，在道路上学习驾驶，应当按照公安机关交通管理部门指定的路线、时间进行。在道路上学习机动车驾驶技能应当使用教练车，在教练员随车指导下进行，与教学无关的人员不得乘坐教练车。学员在学习驾驶中有道路交通安全违法行为或者造成交通事故的，由教练员承担责任。

如果申请人在道路上学驾驶时未按照相关规定，比如未在指定路线、时间学习，或者没有教练员随车指导等情况，这就属于违反了道路交通安全法规。根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。同时，如果是教练没有尽到监管责任，让学员出现违规行为，教练也会面临相应的处罚。另外，这种违规行为可能会对申请人的驾考产生不利影响，有可能导致驾考进程受到阻碍甚至暂停等情况。所以，在道路上学驾驶时一定要严格遵守相关规定。