非普住宅两年后应缴纳的营业税率是多少？

首先，我们来明确一下非普住宅的概念。非普通住宅一般是指建筑面积较大、价格较高等不符合普通住宅标准的房屋。

关于非普住宅两年后缴纳营业税的问题，自2016年5月1日起，我国全面推开营业税改征增值税试点，营业税已退出历史舞台，现在相关业务缴纳的是增值税而非营业税。

根据《营业税改征增值税试点过渡政策的规定》，个人将购买2年以上（含2年）的非普通住房对外销售的，以销售收入减去购买住房价款后的差额按照5%的征收率缴纳增值税。这里的2年时间计算，是从购买住房取得的房屋产权证或者契税完税证明上注明的时间开始算。

举个例子来说，如果您出售的非普住宅售价是500万，当时购买价格是300万，那么需要缴纳的增值税就是（500 - 300）÷（1 + 5%）× 5% = 9.52万（保留两位小数）。

另外，如果是北上广深地区，个人将购买2年以上（含2年）的非普通住房对外销售的，以销售收入减去购买住房价款后的差额按照5%的征收率缴纳增值税；个人将购买2年以上（含2年）的普通住房对外销售的，免征增值税。所以不同地区可能在具体政策执行上会有一定差异，建议您在交易前向当地的税务部门进行详细咨询，以确保准确缴纳相关税费。