法院如何确认股份制合作企业股东资格？

法院在确认股份制合作企业股东资格时，会综合多方面因素进行判断。首先，会审查源泉证据，这是基础性证据，是证明股东取得股权的基础法律关系的法律文件 。比如原始取得股权的源泉证据，就是能证明股东靠自己出资原始取得股权的证据，像设立公司时认缴或实缴出资的证据等。《公司法》第31条规定了出资证明书制度，来帮助原始股东固定与保全证据。

其次，会考虑推定证据的效力。因为股权是股东与公司之间的法律关系，法律推定公司知道自己的股东是谁。根据最高人民法院《公司法解释三》第22条规定：“当事人向人民法院起诉请求确认其股东资格的，应当以公司为被告，与案件争议股权有利害关系的人作为第三人参加诉讼”。

再者，对抗证据也很重要，主要指在公司登记机关登记在案的章程等登记文件。依据《公司法》第32条第3款规定：“公司应当将股东的姓名或名称及其出资额向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或变更登记的，不得对抗第三人”。

当各类证据相互冲突时，法院会区分内部法律关系与外部法律关系。在股东与股东、股东与公司之间的股权确认纠纷中，也就是内部关系，应尽量尊重源泉证据的效力；而在涉及善意第三人的外部关系中，则应尽量尊重对抗证据的效力。总之，法院会综合、全面地考虑各种因素和证据，以准确确认股份制合作企业股东资格。