分居后的收入在离婚时该怎么分割？

首先，需要明确的是，夫妻分居期间仍然属于夫妻关系存续期间。在此期间获得的收入，如果双方没有对此进行特殊约定，那么应当认定为夫妻共同财产。这是因为从法律角度看，只要婚姻关系没有正式解除，夫妻双方在经济上通常仍处于共同生活的状态。

关于具体的分割方式，根据相关法律规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理。也就是说，夫妻双方可以根据实际情况，通过协商来确定分居期间收入的具体分割方案，比如按照一定的比例分配，或者根据收入的具体来源和用途进行分配等。这体现了法律对当事人自主意愿的尊重，只要双方达成的协议不违反法律法规的强制性规定，都是有效的。

如果双方无法达成协议，那么就需要由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。例如，如果一方在分居期间对家庭付出较多，或者另一方存在过错行为导致分居，法院在分割财产时可能会适当倾向于付出较多或者无过错的一方。这一原则是为了保障在婚姻关系中处于相对弱势或者无过错一方的合法权益，体现了法律的公平和公正。