协助执行单位将款项支付给他人该如何处理？

在司法执行程序中，协助执行单位承担着配合法院执行工作的重要责任。当协助执行单位未按照法院的要求，擅自将款项支付给他人时，这是一种违反法律规定的行为。

根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》第30条规定，有关单位收到人民法院协助执行被执行人收入的通知后，擅自向被执行人或其他人支付的，人民法院有权责令其限期追回；逾期未追回的，应当裁定其在支付的数额内向申请执行人承担责任。也就是说，法院首先会要求协助执行单位把支付出去的款项追回来。

如果协助执行单位在规定的期限内没有追回款项，法院会裁定该单位在支付的数额范围内，向申请执行人承担赔偿责任。比如，协助执行单位擅自支付了10万元给他人，在无法追回的情况下，就需要由该单位拿出这10万元支付给申请执行人。

另外，依据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十四条规定，有义务协助调查、执行的单位有下列行为之一的，人民法院除责令其履行协助义务外，并可以予以罚款；对其主要负责人或者直接责任人员予以罚款；对仍不履行协助义务的，可以予以拘留；并可以向监察机关或者有关机关提出予以纪律处分的司法建议。这里所指的行为就包括有关单位拒绝或者妨碍人民法院调查取证，以及有关单位接到人民法院协助执行通知书后，拒不协助查询、扣押、冻结、划拨、变价财产等情况。所以，协助执行单位擅自支付款项的行为，法院有权对该单位及其主要负责人或直接责任人员进行罚款等处罚。

作为申请执行人，如果遇到协助执行单位将款项支付给他人的情况，要及时向执行法院反映，配合法院的工作，推动法院采取责令追回款项、裁定协助执行单位承担责任以及进行处罚等措施，以此来维护自己的合法权益。