第三者怀孕不同意做流产该怎么办？

在这种情况下，需要从不同方面来分析相关法律问题：

首先，从第三者的生育选择权来看，是否生育是当事人的自由，法律不能过分干预。也就是说，第三者有权自主决定是否继续妊娠，他人包括其配偶、男方等都不能强制要求她进行流产。这是基于对个人身体权和生育权的尊重，每个人都有权利决定自己的身体状况和生育计划。

其次，对于女方（婚姻中的无过错方）来说，如果男方出轨导致第三者怀孕，女方可以选择离婚，并且要求男方支付离婚损害赔偿。依据《民法典》第一千零九十一条规定，有重婚、与他人同居等情形，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。

再者，关于孩子出生后的抚养问题。如果第三者生下孩子，男方作为孩子的生父，即便不愿意抚养，也需要支付抚养费。根据《民法典》第一千零七十一条规定，非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。不直接抚养非婚生子女的生父或者生母，应当负担未成年子女或者不能独立生活的成年子女的抚养费。

另外，如果第三者怀孕的情况构成重婚，还可能涉及刑事责任。《刑法》第二百五十八条规定，有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的，处二年以下有期徒刑或者拘役。不过，这里的重婚认定需要符合一定的法律条件，并非只要第三者怀孕就构成重婚。

最后，如果在未婚先孕的情形下，女方因为做人工流产而花费的医疗费，由于与男方有因果关系，可要求男方分担；若女方担心做人工流产而导致不孕，选择将孩子生产，孩子出生后，只要女方要求，男方均应承担孩子的抚养费。