工程合同纠纷哪些法院具有案件管辖权？

在工程合同纠纷中，明确具有管辖权的法院是启动诉讼程序的重要前提。首先，我们需要了解两个关键的法律概念，即专属管辖和协议管辖。

专属管辖是法律规定某些类型的案件只能由特定的法院管辖，其他法院无权管辖，当事人也不能通过协议改变管辖法院。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条规定，因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。建设工程施工合同纠纷就属于不动产纠纷的范畴。也就是说，工程合同纠纷通常由工程所在地的法院专属管辖。这是因为工程作为不动产，与所在地的联系最为紧密，由工程所在地法院管辖，便于法院进行现场勘查、调查取证等工作，更好地查明案件事实。

除了专属管辖，如果合同双方在签订工程合同时，在合同中明确约定了发生纠纷时的管辖法院，并且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，那么就按照协议管辖来确定管辖法院。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。例如，合同双方约定由合同签订地的法院管辖，且该约定符合法律规定，那么当发生纠纷时，就应向合同签订地的法院提起诉讼。

综上所述，对于工程合同纠纷，一般情况下由工程所在地法院专属管辖，但如果合同中有合法有效的协议管辖条款，则按照协议约定确定管辖法院。当事人在遇到工程合同纠纷时，应根据具体情况准确确定管辖法院，以保障自己的合法权益。