鉴定机构是由法院指定进行鉴定吗？

在司法实践中，鉴定机构的确定并不完全是由法院来指定的，存在多种情形。

首先，依据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第三十二条，人民法院准许鉴定申请的，应当组织双方当事人协商确定具备相应资格的鉴定人。也就是说，在诉讼过程中，如果有鉴定的需求，法院会先让双方当事人自行协商选定鉴定机构。这种方式尊重了当事人的意愿，给予了双方一定的自主性。比如在一个合同纠纷案件中，双方对于合同标的的价值有争议需要鉴定，就可以先尝试协商确定一个大家都认可的鉴定机构。

如果双方当事人协商不成的，那么由人民法院指定鉴定机构。这是为了保证在双方无法达成一致意见时，鉴定程序能够顺利进行。例如在一些人身损害赔偿案件中，涉及到伤残等级鉴定，双方无法协商出鉴定机构，此时就由法院指定。

此外，在某些情况下，当事人也可以自行委托鉴定。自行委托鉴定得出的鉴定意见，也可以作为证据提交给法院，但对方当事人可能会对其真实性、可靠性提出质疑。法院会对自行委托的鉴定意见进行审查，如果另一方有证据足以反驳并申请重新鉴定的，人民法院一般会准许。所以，虽然当事人有自行委托鉴定的权利，但为了避免后续的争议，最好还是通过协商或者法院指定的方式确定鉴定机构。

综上所述，鉴定机构的确定存在当事人协商、法院指定以及当事人自行委托等多种情况，要根据具体的案件和实际情况来决定。