迟到扣工资且加班没有加班费这种做法合法吗？

这种做法是不合法的。

首先，关于加班没有加班费的问题。加班是指劳动者在法定工作时间之外，根据用人单位的要求继续从事工作。根据我国《劳动法》第四十四条规定，用人单位安排劳动者延长工作时间的，应当支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。也就是说，企业安排员工加班，就必须按照规定支付相应的加班报酬，不支付是违反法律规定的。

其次，关于迟到扣工资的问题。虽然用人单位可以制定规章制度来规范员工的出勤情况，但扣工资应当在合理合法的范围内。一般来说，用人单位需要有明确的规章制度规定迟到扣工资的具体情形和标准，并且该规章制度应当经过民主程序制定并向员工公示。如果用人单位随意克扣员工工资，也是违法的行为。

如果遇到这种情况，员工可以先与用人单位进行协商，要求其支付加班报酬并纠正不合理的扣工资行为。如果协商不成，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。