新公司增值税辅导期由谁管理呢？

新公司增值税辅导期的管理主要由税务机关负责。增值税辅导期是针对一些新办的小型商贸批发企业和国家税务总局规定的其他企业设定的一段特殊管理时期。

从法律依据来看，根据《增值税一般纳税人纳税辅导期管理办法》，主管税务机关会对实行纳税辅导期管理的增值税一般纳税人进行管理。这里的主管税务机关通常指的是企业所在地的区县级税务局及其下属的税务分局等派出机构。

在辅导期内，税务机关会对企业进行多方面的管理。首先，在发票管理方面，实行限量限额发售专用发票。每次发售专用发票数量不得超过25份，而且企业按规定预缴增值税后，可凭主管税务机关出具的缴款凭证，向主管税务机关申请增购专用发票。

其次，对于进项税额抵扣，取得的增值税专用发票抵扣联、海关进口增值税专用缴款书以及运输费用结算单据应当在交叉稽核比对无误后，方可抵扣进项税额。税务机关会通过交叉稽核比对等方式，确保企业进项税额抵扣的真实性和合法性。

另外，税务机关还会对企业的纳税申报情况进行严格监管，要求企业按照规定的期限和要求进行纳税申报，如实填写纳税申报表及相关资料。若企业存在违规行为，税务机关会按照税收征管法等相关法律法规进行处理。总之，税务机关在新公司增值税辅导期管理中起着关键作用，以保障税收征管秩序和国家税收收入。