夫妻离婚女方想要三个孩子但男方不同意，通过法院会怎么判？

在夫妻离婚且对三个孩子抚养权协商不一致，需通过法院判决的情况下，法院会依据相关法律规定，按照最有利于未成年子女的原则来进行判定。

首先，依据《民法典》第一千零八十四条规定，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

对于孩子抚养权的具体判定，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。这是因为这个阶段的孩子更需要母亲的照顾和关爱，母亲的陪伴对其成长较为有利。

已满两周岁的子女，法院会根据双方的具体情况来判断。比如，一方已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的；无其他子女，而另一方有其他子女的；子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的 ，这些情形下会优先考虑该方获得抚养权。此外，如果父母双方抚养子女的条件基本相同，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，也会作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。

子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。八周岁以上的孩子已经有了一定的认知和判断能力，他们的意愿在抚养权判决中会起到重要作用。

所以，法院会综合多方面因素来判决，并非一定会将三个孩子都判给女方或男方，关键是看怎样的安排对孩子成长最为有利。