农业发展有限公司的增值税如何计算？

首先，我们来了解一下增值税的基本概念。增值税是对商品生产、流通、劳务服务中多个环节的新增价值或商品的附加值征收的一种流转税。对于农业发展有限公司而言，增值税的计算会受到多种因素的影响。

依据《中华人民共和国增值税暂行条例》规定，农业生产者销售的自产农产品免征增值税。这里的农业生产者，既包括从事农业生产的单位，也包括从事农业生产的个人。所以，如果农业发展有限公司销售的是自己种植、养殖、采摘等生产的农产品，那么这部分收入是不需要缴纳增值税的。

不过，如果公司销售的不是自产农产品，而是购进后再销售的农产品，就需要按照规定缴纳增值税。一般纳税人销售农产品，增值税税率通常为9%。其应纳税额的计算公式为：应纳税额 = 当期销项税额 - 当期进项税额。当期销项税额 = 销售额×税率，销售额是指纳税人销售货物或者应税劳务向购买方收取的全部价款和价外费用，但不包括收取的销项税额。当期进项税额是指纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额。

例如，一家农业发展有限公司当期销售购进的农产品取得销售额100万元，适用税率9%，那么当期销项税额 = 100×9% = 9万元。如果当期购进这些农产品时取得了合法的增值税扣税凭证，上面注明的进项税额为6万元，那么当期应纳税额 = 9 - 6 = 3万元。

小规模纳税人销售农产品，征收率为3%（目前有税收优惠政策，征收率减按1%）。应纳税额 = 销售额×征收率，这里的销售额同样是不含税销售额。若小规模纳税人当期销售农产品取得含税销售额50.5万元，换算为不含税销售额 = 50.5÷(1 + 1%) = 50万元，应纳税额 = 50×1% = 0.5万元。