物流公司开票另外收费是否合法？

在探讨物流公司开票另外收费是否合法这个问题之前，我们先了解一下相关的法律概念。发票是指一切单位和个人在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的业务凭证，是会计核算的原始依据，也是审计机关、税务机关执法检查的重要依据。

《中华人民共和国发票管理办法》第十九条规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。从这条规定可以看出，当物流公司为客户提供了运输服务并收取运费后，就有义务为客户开具发票，开具发票是其经营活动的一部分，不应该额外再向客户收取费用。

另外，根据《中华人民共和国消费者权益保护法》第十六条规定，经营者向消费者提供商品或者服务，应当依照本法和其他有关法律、法规的规定履行义务。经营者和消费者有约定的，应当按照约定履行义务，但双方的约定不得违背法律、法规的规定。物流公司提供运输服务，客户支付运费，双方就形成了一种服务合同关系。开发票作为服务的附随义务，包含在运输服务的整体费用当中。如果物流公司额外收取开票费用，就相当于单方面增加了消费者的负担，这是不符合法律规定的，也侵犯了消费者的合法权益。

所以，一般情况下，物流公司开票另外收费是不合法的。若遇到这种情况，消费者可以与物流公司进行协商，要求其按照规定免费开具发票。如果协商不成，消费者可以向税务部门进行投诉举报，税务部门会依据相关规定对物流公司的违法行为进行处理。