缺勤扣加班工资是否有相关法律规定？

首先，一般情况下，用人单位不得随意克扣劳动者工资。《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

对于员工缺勤是否能扣加班工资，法律没有明确禁止，但也不意味着公司可以随意为之。如果双方签订的劳动合同中明确约定了缺勤要扣加班工资，那么在这种情况下公司按约定操作是可以的。

另外，用人单位在特定情形下可以代扣劳动者工资。比如用人单位代扣代缴的个人所得税；代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。但这些情况并不直接适用于缺勤扣加班工资。

还有，如果因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。不过这也和缺勤扣加班工资不是同一回事。

如果公司没有合同约定，也不属于法定代扣情形就扣加班工资，是不合法的。劳动者可以和公司协商，要求给出合理说法，协商不成可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

相关概念：

最低工资标准：是指劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。

劳动仲裁：是指由劳动争议仲裁委员会对当事人申请仲裁的劳动争议居中公断与裁决。当事人如果对仲裁结果不满意，还可以向法院提起诉讼。