男子开房只登记本人身份证后强奸幼女在法律上如何处理？

首先，对于该男子强奸幼女的行为，这是一种极其严重的犯罪行为。在法律概念中，强奸罪是指违背妇女意志，使用暴力、胁迫或者其他手段，强行与妇女发生性交的行为，而奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。

依据《中华人民共和国刑法》第二百三十六条规定，以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。如果存在强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；强奸妇女、奸淫幼女多人的；在公共场所当众强奸妇女、奸淫幼女的；二人以上轮奸的；奸淫不满十周岁的幼女或者造成幼女伤害的；致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的这些情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。

其次，关于男子开房只登记本人身份证这一情况，依据《旅馆业治安管理办法》第六条规定，旅馆接待旅客住宿必须登记。登记时，应当查验旅客的身份证件，按规定的项目如实登记。酒店没有严格执行登记制度，没有要求该男子如实登记其他人员身份信息，属于违反治安管理规定的行为。公安机关可以对该旅馆进行相应的处罚，比如警告、罚款等。