分居三年和他人同居且怀孕该怎么办？

首先，我们来明确一些关键的法律概念。在婚姻关系存续期间，夫妻双方负有互相忠实的义务。这里的忠实义务，通俗来讲就是夫妻之间要专一，不能在婚姻期间和他人有不正当的同居关系。

当出现像您这种分居三年后和他人同居且怀孕的情况，可能会涉及到多方面的法律问题。从婚姻关系角度来看，《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条规定，有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：（一）重婚或者与他人同居；（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；（四）因感情不和分居满二年；（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。您分居三年且与他人同居，配偶如果以此向法院提起离婚诉讼，法院在调解无效的情况下，很可能会判决准予离婚。

另外，关于财产分割方面，民法典第一千零八十七条规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。因为您在婚姻期间与他人同居，在财产分割上可能会少分。

同时，如果您的配偶掌握了您与他人同居且怀孕的证据，还可以依据民法典第一千零九十一条的规定，请求损害赔偿。该条规定，有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：（一）重婚；（二）与他人同居；（三）实施家庭暴力；（四）虐待、遗弃家庭成员；（五）有其他重大过错。

对于您现在的情况，建议您主动和配偶坦诚沟通，协商离婚事宜，包括财产分割、子女抚养等问题。如果协商不成，可以考虑通过法律途径解决，在这个过程中，要积极配合法律程序，保障自己和他人的合法权益。