公积金还款银行卡余额不足只扣了一部分怎么办？

当公积金还款银行卡余额不足只扣了一部分时，首先要明白这属于未足额还款的情况。未足额还款可能会产生逾期记录，影响个人信用，还可能会有逾期费用。

从法律层面来看，根据《住房公积金管理条例》等相关规定，借款人与公积金管理中心或贷款银行签订的借款合同中，通常会明确约定还款的方式、金额和时间等条款。未按照合同约定足额还款，就构成了违约。

一旦发现这种情况，应该立即采取措施。第一步，尽快往还款银行卡里补足剩余的还款金额。因为很多银行会在当天或者之后的一段时间内进行二次补扣。你可以及时联系贷款银行，了解二次补扣的时间，确保在这个时间之前补足款项。

如果已经产生了逾期记录，也不用过于惊慌。可以向贷款银行说明情况，看是否可以申请消除逾期记录。一般来说，如果是首次逾期且逾期时间较短，并且能够及时补足欠款，银行可能会根据实际情况进行处理。同时，在之后的还款过程中，一定要注意提前足额存入还款金额，避免再次出现类似的情况。

另外，有些公积金管理中心或贷款银行可能会有一定的宽限期政策。在宽限期内及时还款，可能不会被认定为逾期。你可以向相关机构咨询是否有这样的政策以及宽限期的具体时长。