个人所得税是如何知道纳税人在哪个区缴纳的？

个人所得税对于纳税人在哪个区缴纳的确定，有一套明确的规则和依据。

首先，对于工资、薪金所得，通常是由扣缴义务人（也就是发放工资的单位）向其机构所在地或者居住地的主管税务机关进行申报纳税。这意味着，如果你在某个公司工作，公司会根据自身的机构所在地或居住地，将你的工资薪金所得对应的个人所得税，向当地的税务机关缴纳。比如，公司注册地在A区，那么一般就会在A区的税务机关为员工申报缴纳个人所得税。依据《中华人民共和国个人所得税法》第十条规定，有下列情形之一的，纳税人应当依法办理纳税申报：（一）取得综合所得需要办理汇算清缴；（二）取得应税所得没有扣缴义务人；（三）取得应税所得，扣缴义务人未扣缴税款；（四）取得境外所得；（五）因移居境外注销中国户籍；（六）非居民个人在中国境内从两处以上取得工资、薪金所得；（七）国务院规定的其他情形。而其中，对于有扣缴义务人的情况，扣缴义务人要按照规定进行申报缴纳。

其次，对于个体工商户的生产、经营所得，纳税人应向经营所在地主管税务机关申报纳税。如果你是个体工商户，在B区经营店铺，那么就需要在B区缴纳个人所得税。根据《个体工商户个人所得税计税办法》第二条规定，实行查账征收的个体工商户应当按照本办法的规定，计算并申报缴纳个人所得税。这里明确了个体工商户在纳税申报方面的责任，并且要在经营所在地进行申报纳税。

再者，对于劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，如果有扣缴义务人，同样由扣缴义务人按规定扣缴税款并向其机构所在地或者居住地主管税务机关申报。若没有扣缴义务人，则纳税人应当在取得所得的次月十五日内向综合所得汇算清缴地主管税务机关办理纳税申报。例如，你为C区的一家公司提供劳务，该公司作为扣缴义务人，会向其所在地税务机关为你申报缴纳相关的个人所得税。若没有扣缴义务人，你就需要按照规定向综合所得汇算清缴地税务机关申报。

另外，财产租赁所得，以被租赁财产的所在地为纳税地点；财产转让所得，转让不动产的，以不动产所在地为纳税地点；转让其他财产的，以转让人居住地为纳税地点。比如你转让位于D区的一套房产，那么就需要在D区缴纳相关的个人所得税。这都是依据相关税收法规来确定纳税地点的。总之，税务机关通过这些明确的规定和申报流程，来确定纳税人该在哪个区缴纳个人所得税。