退税后公司知道了该怎么处理？

首先，我们要明白退税是纳税人根据国家税收政策，对多缴纳税款进行的合法取回行为。依据《中华人民共和国税收征收管理法》第五十一条规定，纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还。

一般情况下，个人退税是个人与税务机关之间的事情，属于个人合法权益的行使，公司通常无权干涉。但如果退税涉及公司代扣代缴的情况，可能需要和公司进行适当沟通。比如公司代扣代缴个人所得税时计算有误导致多扣，你申请退税后公司知晓，这种情况下你可以向公司说明是依据法律规定对多缴税款的正常退还。

要是公司因为你退税而采取不合理的措施，比如以此为由克扣工资、给予不合理处分等，这就可能侵犯了你的合法权益。根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，劳动者享有获得劳动报酬和公平对待的权利。你可以和公司友好协商，若协商不成，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的权益。

所以，退税后公司知道了，先判断是否与公司代扣代缴有关，然后依据具体情况进行沟通或者采取必要的维权措施。