人民检察院直接侦查案件应该如何处理？

人民检察院直接侦查的案件主要是针对一些特定类型的犯罪，在处理这些案件时有着严格的流程和规定。

首先，人民检察院在发现有犯罪事实需要追究刑事责任时，会进行立案。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，人民检察院对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，应当立案。这是处理案件的起始步骤，意味着案件正式进入司法程序。

立案之后就是侦查阶段。人民检察院在侦查过程中，有权采取各种侦查措施，比如讯问犯罪嫌疑人、询问证人、进行勘验、检查、搜查、查封、扣押物证、书证、鉴定等。例如，讯问犯罪嫌疑人时，应当依照法定程序进行，保障犯罪嫌疑人的合法权益。同时，根据《刑事诉讼法》的要求，侦查人员在进行搜查等活动时，必须出示相关的证件和文书。

当侦查终结后，人民检察院会根据不同的情况作出不同的处理。如果案件事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，人民检察院会作出起诉决定。将案件移送至人民法院进行审判。依据《刑事诉讼法》，人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉。

如果发现不应当对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，人民检察院会作出不起诉决定。这可能是因为犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的；或者犯罪嫌疑人没有犯罪事实等情况。《刑事诉讼法》明确规定了这些不起诉的情形。

此外，在整个处理过程中，人民检察院还需要保障犯罪嫌疑人、被害人等诉讼参与人的合法权益。犯罪嫌疑人有权获得辩护，被害人有权提出附带民事诉讼等。人民检察院要严格依照法律规定的程序进行操作，确保案件处理的公正性和合法性。总之，人民检察院处理直接侦查案件是一个严谨且有章可循的过程，每一个环节都有相应的法律依据和要求。