离婚时两个孩子抚养权案件该如何处理？

在离婚时涉及两个孩子抚养权的案件中，首先要明确抚养权的基本概念。抚养权是指父母对其子女的一项人身权利，拥有该权利的一方或双方，在子女成年之前，有权决定是否与子女共同生活，该权利在子女成年时即消灭。

根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条规定，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。

对于两个孩子的抚养权分配，司法实践中通常会综合考虑多种因素。如果孩子都不满两周岁，原则上一般会判给母亲抚养，但如果母亲存在不适合抚养孩子的情形，比如患有严重疾病、有虐待孩子等行为，那么也可能判给父亲。

当孩子已满两周岁时，法院会从双方的经济状况、居住条件、教育背景、陪伴孩子的时间等方面来考量，看哪一方的条件更有利于孩子的成长。例如，一方有稳定的收入，能为孩子提供良好的生活和学习环境，另一方收入不稳定且居无定所，那么有优势条件的一方可能更有机会获得抚养权。

如果孩子已满八周岁，法院会充分尊重孩子的意愿。这是因为八周岁以上的孩子已经有了一定的认知和判断能力，他们可以表达自己更愿意和哪一方生活。

另外，如果父母双方能够就两个孩子的抚养权达成协议，且该协议不损害孩子的利益，法院一般会尊重双方的意愿。比如双方协商一致两个孩子都由一方抚养，另一方支付抚养费，这种情况也是被允许的。