海上运输合同发生纠纷时管辖法院如何确定？

在海上运输合同发生纠纷时，管辖法院的确定需要依据相关的法律规定。

首先，根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。也就是说，如果在海上运输合同中，双方当事人已经通过书面协议约定了管辖法院，并且该约定不违反法律规定，那么就应当按照约定来确定管辖法院。例如，双方约定一旦发生纠纷由合同签订地的法院管辖，那么当纠纷发生时，就由合同签订地的法院来处理。

其次，如果当事人没有约定管辖法院，那么就要按照法定管辖的规则来确定。《中华人民共和国民事诉讼法》第二十四条规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。在海上运输合同纠纷中，被告住所地比较容易理解，就是被告一方的主要办事机构所在地或者注册登记地。而合同履行地的确定相对复杂一些，对于海上运输合同，装货港、卸货港通常可以视为合同履行地。所以，没有约定管辖时，原告可以选择向被告住所地、装货港所在地或者卸货港所在地的法院起诉。

另外，根据《最高人民法院关于海事法院受理案件范围的规定》，海上运输合同纠纷案件属于海事法院专属管辖的范围。因此，无论是约定管辖还是法定管辖，最终确定的管辖法院应该是有管辖权的海事法院。比如，上海、广州、天津等地都设有专门的海事法院，它们负责审理相关的海上运输合同纠纷案件。

综上所述，确定海上运输合同纠纷的管辖法院，要先看当事人之间有无有效的管辖协议，有协议按协议；没有协议则按照法定管辖规则，由被告住所地或者合同履行地的海事法院管辖。这样的规定旨在明确纠纷解决的途径，保障当事人的合法权益，使海上运输合同纠纷能够得到及时、公正的处理。