子公司将商品房给母公司应该怎样纳税？

子公司将商品房给母公司这一行为，涉及到多个税种的缴纳问题，以下为您详细介绍：

首先是增值税。在增值税方面，子公司将商品房给母公司的行为，通常被视为销售不动产，需要缴纳增值税。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》规定，销售不动产的增值税税率一般为9%。不过，如果子公司是小规模纳税人，则按照简易计税方法，征收率为5%。计税依据是子公司转让商品房所取得的全部价款和价外费用。若子公司销售其2016年4月30日前取得（不含自建）的不动产，可以选择适用简易计税方法，以取得的全部价款和价外费用减去该项不动产购置原价或者取得不动产时的作价后的余额为销售额，按照5%的征收率计算应纳税额。

其次是土地增值税。土地增值税是对转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物并取得收入的单位和个人征收的一种税。根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》，子公司转让商品房的行为，若增值额未超过扣除项目金额50%的部分，税率为30%；增值额超过扣除项目金额50%、未超过扣除项目金额100%的部分，税率为40%；增值额超过扣除项目金额100%、未超过扣除项目金额200%的部分，税率为50%；增值额超过扣除项目金额200%的部分，税率为60%。在计算土地增值税时，需要确定扣除项目金额，包括取得土地使用权所支付的金额、房地产开发成本、房地产开发费用等。

再者是企业所得税。子公司转让商品房取得的收入，应计入企业的应纳税所得额，缴纳企业所得税。根据《中华人民共和国企业所得税法》，企业所得税的税率为25%。子公司需要按照规定进行年度汇算清缴，将转让商品房的收入和成本等进行核算，计算出应纳税所得额，然后缴纳相应的企业所得税。

另外还有契税。契税是在土地、房屋权属发生转移时，向承受土地使用权、房屋所有权的单位和个人征收的一种税。在子公司将商品房给母公司的过程中，母公司作为承受方，需要缴纳契税。根据《中华人民共和国契税法》，契税税率为3% - 5%，具体税率由各省、自治区、直辖市人民政府在规定的幅度内按照本地区的实际情况确定。

印花税也是需要考虑的。子公司与母公司签订的商品房转让合同，属于产权转移书据，双方都需要按照合同所载金额的万分之五缴纳印花税。

在纳税流程上，子公司和母公司需要按照规定的纳税期限，向当地税务机关申报纳税。一般来说，增值税和企业所得税需要按规定的期限进行预缴，年度终了后进行汇算清缴；土地增值税在项目转让时进行清算；契税和印花税在办理产权转移手续时缴纳。子公司和母公司应当妥善保存相关的合同、发票等凭证，以备税务机关检查。