已经在耕地上建房了该怎么办？

当遇到已经在耕地上建房的情况时，首先要明白耕地有着特殊的法律保护地位。根据《中华人民共和国土地管理法》规定，国家严格限制农用地转为建设用地，控制建设用地总量，对耕地实行特殊保护。也就是说，一般情况下是不允许随意在耕地上建房的。

如果在耕地上的建房行为是未经批准的，这就属于违法占地建设。依据法律，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。

不过，也存在一些特殊情况和补救措施。要是建房行为符合土地利用总体规划，且经过相关部门的审批补办了手续，那么可能可以使建房行为合法化。例如，在符合乡村规划和相关政策的前提下，向当地的自然资源和规划部门、农业农村部门等提出申请，说明情况，按照要求提交资料，通过审批后缴纳相应的费用等，使建房行为得到认可。

如果建房不符合规划，但属于一些历史遗留问题，当地政府可能会根据具体情况进行妥善处理，不一定会直接拆除。比如在一些农村地区，早期由于管理不规范等原因存在在耕地上建房的情况，政府可能会采取合理的整改措施，而不是“一刀切”地拆除。

所以，当发现自己已经在耕地上建房后，要及时主动地向当地的自然资源和规划部门等相关政府部门报告情况，积极配合调查和处理。这样可以最大程度地避免损失，争取合法合理的解决方案。