协议离婚法院会有案底吗？

首先，我们要明确“案底”的概念。通常所说的案底一般是指某人过去违法或犯罪行为的记录，也就是犯罪人员犯罪记录制度。而协议离婚是夫妻双方自愿达成离婚协议，然后到婚姻登记机关办理离婚登记手续来解除婚姻关系，并不是通过法院的诉讼程序来离婚。

从法律程序上来说，协议离婚和法院没有直接关联。根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条规定，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。这表明协议离婚是在婚姻登记机关的操作流程下完成的，整个过程不需要经过法院审判。

所以，协议离婚在法院是不会有案底的。不过，婚姻登记机关会有相应的离婚登记档案。这些档案是为了记录婚姻状态的变更，主要用于婚姻登记管理等相关工作，和我们通常理解的违法犯罪的案底是完全不同的概念。