劳务派遣公司差额征税如何开票？

首先，我们来了解一下劳务派遣公司差额征税开票的相关概念。差额征税是指纳税人以取得的全部价款和价外费用扣除支付给其他纳税人的规定项目价款后的销售额来计算税款的计税方法。对于劳务派遣公司而言，就是以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额。

根据《国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点有关税收征收管理事项的公告》（国家税务总局公告2016年第23号）规定，按照现行政策规定适用差额征税办法缴纳增值税，且不得全额开具增值税发票的（财政部、税务总局另有规定的除外），纳税人自行开具或者税务机关代开增值税发票时，通过新系统中差额征税开票功能，录入含税销售额（或含税评估额）和扣除额，系统自动计算税额和不含税金额，备注栏自动打印“差额征税”字样，发票开具不应与其他应税行为混开。

劳务派遣公司差额征税开票的具体操作流程如下：

第一步，在开票系统中选择“差额征税开票”功能。不同的开票软件，该功能的位置可能有所不同，但一般都能在发票开具的相关菜单中找到。

第二步，录入含税销售额。这个含税销售额就是劳务派遣公司从用工单位收取的全部价款和价外费用。

第三步，录入扣除额。扣除额就是代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金的金额。

第四步，系统会自动计算税额和不含税金额。计算完成后，会在发票上显示相应的金额和税额。

第五步，确认发票信息无误后，点击打印，完成发票开具。

在开票过程中，还需要注意以下几点：

一是扣除额部分不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。因为这部分金额实际上并不是劳务派遣公司的收入，而是代付的款项，所以不能开具专票进行抵扣。

二是发票备注栏必须自动打印“差额征税”字样，以明确该发票是按照差额征税办法开具的。

三是要妥善保管好扣除项目的相关凭证，如工资发放清单、社保缴纳凭证等，以备税务机关核查。这些凭证是证明扣除额真实性和合法性的重要依据。