发票备注个人所得税由支付人扣缴该如何申报？

在解答发票备注个人所得税由支付人扣缴如何申报之前，先解释一下相关概念。个人所得税是以个人取得的各项应税所得为对象征收的一种税，这里说的由支付人扣缴，就是支付款项的一方要帮取得收入的一方代扣并缴纳个人所得税。

依据《中华人民共和国个人所得税法》第九条规定，个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。

申报的流程大致如下：首先，支付人需要进行人员信息采集。在相关申报系统（通常是自然人电子税务局扣缴端）中录入纳税人的基本信息，比如姓名、身份证号码、联系方式等，并且要确保这些信息准确无误。完成人员信息采集后，系统会对信息进行验证，只有验证通过才能继续后续操作。

其次，进行收入及扣除信息填写。根据实际支付的所得项目，在系统中准确填写收入金额、扣除项目等内容。不同的所得项目，如工资薪金所得、劳务报酬所得等，填写的要求和方式会有所不同。比如劳务报酬所得，可能还需要考虑扣除一定的费用后再计算应纳税所得额。

然后，进行税款计算。系统会根据填写的收入及扣除信息，按照相应的税率和计算方法自动计算出应扣缴的个人所得税税额。支付人要仔细核对计算结果，确保准确。

最后，进行申报和缴纳税款。在规定的申报期限内，通过系统提交申报数据。申报成功后，按照系统提示完成税款的缴纳。缴纳方式可以选择银行端查询缴税、三方协议缴税等。

需要注意的是，支付人要按照规定的时间进行申报和缴纳税款，逾期可能会产生滞纳金等不利后果。同时，要妥善保存与扣缴个人所得税相关的资料，以备税务机关检查。