因为公司车违章逾期未处理被扣留驾驶证合法吗？

首先，我们来明确一下关于扣留驾驶证的相关法律规定。根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》，公安机关交通管理部门可以依法扣留机动车驾驶证的情形有多种。

一般来说，如果驾驶人有累积记分达到规定分值、饮酒后驾驶机动车、将机动车交由未取得机动车驾驶证或者机动车驾驶证被吊销、暂扣的人驾驶、驾驶机动车行驶超过规定时速百分之五十等情况，交管部门有权扣留其驾驶证。

而仅仅因为公司车违章逾期未处理，通常情况下，交通管理部门不会直接扣留驾驶证。公司车辆违章的责任主体是车辆所属单位，虽然驾驶人可能在驾驶过程中导致了违章，但逾期未处理的责任归属并非直接指向要扣留驾驶人的驾驶证。

不过，如果在处理公司车违章时，驾驶人在交通管理部门通知处理违章后，仍然拒不配合，存在故意逃避处理违章的行为，那么根据《道路交通安全法》及其实施条例，以及相关的处理程序规定，交通管理部门可能会采取进一步措施。在这种情况下，若情节严重，不排除会暂扣驾驶证以督促驾驶人或车辆所属单位处理违章。

所以，如果是因为公司车违章逾期未处理，交通管理部门就扣留了驾驶证，驾驶人可以先与交通管理部门沟通，了解扣留驾驶证的具体依据和原因。如果认为扣留行为不合理，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼来维护自己的合法权益。在申请行政复议时，要准备好相关的证据，比如自己并非故意逾期未处理等证据材料。在行政诉讼中，法院会根据具体的事实和法律规定来判断交通管理部门的扣留行为是否合法。