差额开票时，申报水利基金的计税依据是什么？

首先，我们来明确一下水利基金和差额开票这两个概念。水利基金是用于水利建设的专项资金，由中央水利建设基金和地方水利建设基金组成。而差额开票，简单来说就是纳税人采用差额征税的方式开具发票，也就是以取得的全部价款和价外费用，扣除支付给规定范围纳税人的规定项目价款后的余额来开具发票。

在确定差额开票时申报水利基金的计税依据方面，根据相关规定，水利建设基金一般按照销售收入或者营业收入等作为计征依据。对于实行差额征税的业务，计税依据通常是差额后的销售额。

以《水利建设基金筹集和使用管理办法》等相关政策来看，其目的是为了规范水利基金的征收和使用。当纳税人采用差额开票时，这就意味着业务存在扣除项目。在申报水利基金时，要以实际的应税收入来计算。也就是说，应该按照差额后的销售额来作为水利基金的计税依据。例如，某企业提供旅游服务，取得全部价款和价外费用100万元，扣除替旅游者支付给其他单位或者个人的住宿费、餐费、交通费、旅游景点门票等费用80万元，那么差额后的销售额就是20万元，此时申报水利基金就应以这20万元作为计税依据。

不过，不同地区对于水利基金的具体政策可能会存在一定差异。有些地方可能会有更详细的规定或者特殊的优惠政策。所以，纳税人在进行水利基金申报时，除了依据上述一般性原则确定计税依据外，还需要密切关注当地税务机关发布的具体政策文件和要求，确保准确申报缴纳水利基金，避免因政策理解不准确而带来税务风险。