公司代扣个税跨年后降低税率该怎么办？

首先，我们来了解一下个人所得税代扣代缴的基本概念。个人所得税代扣代缴是指公司在支付员工工资时，按照规定计算并扣除员工应缴纳的个人所得税，然后将扣除的税款上缴给税务机关。这是公司的一项法定义务，目的是确保国家税收的及时足额征收。

当跨年后税率降低时，根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，以及相关的税收征管规定，会有相应的处理方式。

从公司角度来看，公司有责任按照新的税率标准进行代扣代缴。在税率降低的情况下，公司应该在新的纳税年度开始时，及时调整代扣个税的计算方式和金额。因为税务机关通常会发布新的税率表和相关政策，公司需要根据这些最新规定来操作。如果公司没有及时调整，继续按照原来较高的税率代扣，这可能会导致多扣员工的税款，损害员工的利益。

对于员工而言，如果发现公司没有按照降低后的税率代扣个税，可以先与公司的财务部门沟通。向他们说明跨年后税率已经降低的情况，要求他们按照新的税率重新计算和代扣。在沟通时，员工可以提供相关的政策文件或税务机关的通知作为依据，以便更有效地解决问题。

如果与公司沟通后问题仍然没有得到解决，员工可以向当地的税务机关进行反映。税务机关有专门的渠道和机制来处理这类问题，他们会对公司的代扣代缴情况进行调查和核实。如果确实存在公司未按规定代扣个税的情况，税务机关会要求公司进行整改，并可能对公司进行相应的处罚。同时，员工多缴纳的税款也会按照规定进行退还。

此外，员工自己也可以通过个人所得税APP等渠道，查询自己的纳税记录和申报情况。如果发现存在多扣税的情况，可以在年度汇算清缴时，按照规定申请退税。年度汇算清缴是指在一个纳税年度结束后，纳税人对全年的综合所得进行汇总计算，多退少补。通过年度汇算清缴，员工可以准确计算自己实际应缴纳的税款，将多缴纳的部分退回来。

总之，当公司代扣个税跨年后降低税率时，员工要积极维护自己的合法权益，通过与公司沟通、向税务机关反映等方式来解决问题。同时，要关注个人所得税的申报和汇算清缴工作，确保自己的纳税情况准确无误。