部门工资留出来的钱该怎么算？

在法律层面，部门留存工资里的钱这种情况涉及到工资支付和劳动者权益的问题。首先，我们要明白工资的概念。工资是用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬。

《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这里所说的“克扣”，是指用人单位无正当理由扣减劳动者应得工资。所以，如果部门没有合理的依据和法定的情形，留存工资里的钱很可能构成克扣工资的违法行为。

在一些特殊情况下，用人单位可以代扣劳动者工资。根据《工资支付暂行规定》第十五条，用人单位可以代扣的情况包括：用人单位代扣代缴的个人所得税；用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。如果部门留存工资里的钱不属于这些法定代扣情形，那么这种行为是不合法的。

假设部门留存工资是用于某些合理的集体活动经费等，也应当经过民主协商，获得劳动者的同意。并且在计算留存金额时，不能违反法律法规的规定，不能影响劳动者的基本生活和合法权益。如果劳动者遇到不合理的工资留存情况，可以与用人单位进行协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。