新药侵犯研究所专利权案该如何处理？

在新药侵犯研究所专利权的案件中，我们首先需要了解一些基本的法律概念。专利权是指专利权人对其发明创造享有的独占权，这意味着未经专利权人许可，他人不得实施其专利技术。就新药而言，研究所对其研发的新药拥有专利，就有权禁止他人未经授权制造、使用、销售、许诺销售或进口该新药。

依据《中华人民共和国专利法》，侵犯专利权的行为是违法的。当研究所发现新药被侵犯专利权时，有多种途径可以维护自身权益。

第一种途径是协商解决。这是一种比较温和的方式，研究所可以先与侵权方进行沟通，要求其停止侵权行为，并赔偿损失。协商解决的好处是可以避免繁琐的法律程序，节省时间和成本。如果双方能够达成一致，签订和解协议，明确侵权方的停止侵权行为以及赔偿方式和金额等内容，问题就可以得到妥善解决。

如果协商不成，研究所可以选择请求管理专利工作的部门处理。管理专利工作的部门有权认定侵权行为是否成立。一旦认定侵权成立，其可以责令侵权方立即停止侵权行为。当事人如果对处理决定不服，可以在收到处理通知之日起十五日内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉。侵权人期满不起诉又不停止侵权行为的，管理专利工作的部门可以申请人民法院强制执行。此外，管理专利工作的部门还可以就侵犯专利权的赔偿数额进行调解；调解不成的，当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民法院起诉。

另一种途径就是直接向人民法院起诉。研究所作为专利权人需要准备充分的证据，证明自己拥有该新药的专利权，以及侵权方实施了侵权行为。法院在审理过程中，会依据相关法律规定和证据来判断侵权行为是否成立。如果法院认定侵权成立，会根据具体情况判决侵权方承担停止侵权、赔偿损失等民事责任。赔偿数额按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定。权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该专利许可使用费的倍数合理确定。赔偿数额还应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。

在整个处理过程中，研究所要注意收集和保存好相关证据，如新药的研发资料、专利证书、侵权产品的样本、销售记录等，这些证据对于维护自身权益至关重要。同时，要及时采取措施，避免侵权行为给自己造成更大的损失。