专票不抵扣勾选后申报系统该怎么处理？

在处理专票不抵扣勾选后申报系统的问题时，我们需要清晰几个关键步骤和相关法律依据。

首先，让我们来明确增值税专用发票不抵扣勾选的含义。当企业取得专票，但由于各种原因（如用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费等）不能抵扣进项税额时，就可以选择不抵扣勾选。这一操作实际上是企业主动放弃了该专票对应的进项税额抵扣权利。

根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第十条规定，下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产等。这为不抵扣勾选提供了法律依据。

接下来，我们看看在申报系统中的具体处理流程。在增值税发票综合服务平台进行不抵扣勾选操作后，该发票的信息会自动传输到申报系统。在填写增值税纳税申报表时，不需要将这张专票的进项税额填入“进项税额”相关栏次。因为不抵扣勾选意味着这部分税额不会参与到进项税额的计算和抵扣中。

同时，企业要注意留存好相关的发票和不抵扣勾选的记录，以备税务机关核查。如果后续发现原本不应该进行不抵扣勾选的情况，企业需要按照规定的程序进行更正申报等操作。

在实际操作中，企业应当严格按照税法规定和申报系统的操作指南进行处理。如果对不抵扣勾选和申报系统处理存在疑问，可以咨询当地税务机关或者专业的税务顾问，以确保税务申报的准确性和合规性。