大股东起诉请求未获支持，二房东擅自转租协议是否无效，三房客在屋顶通信如何处理？

在分析这个问题时，我们需要分两部分来看，一是二房东擅自转租协议的效力问题，二是三房客在屋顶进行通信的处理办法。

首先，关于二房东擅自转租协议的效力。根据《中华人民共和国民法典》第七百一十六条规定，承租人经出租人同意，可以将租赁物转租给第三人。承租人转租的，承租人与出租人之间的租赁合同继续有效；第三人造成租赁物损失的，承租人应当赔偿损失。承租人未经出租人同意转租的，出租人可以解除合同。也就是说，在没有得到原房东（出租人）同意的情况下，二房东擅自与三房客签订的转租协议，原房东有权解除该协议。不过，从三房客的角度来看，在签订转租协议时，如果二房东隐瞒了未经同意转租的事实，三房客可以根据合同相对性原则，要求二房东承担违约责任，赔偿自己因此遭受的损失。

其次，对于三房客在屋顶进行通信的情况。这可能涉及到多方面的法律问题。从物权角度看，屋顶一般属于建筑物的共有部分，其使用通常需要经过全体业主或相关管理方的同意。如果三房客未经许可在屋顶进行通信设备的安装等操作，可能构成对其他业主共有权的侵犯。根据《中华人民共和国民法典》第二百八十条规定，业主大会或者业主委员会的决定，对业主具有法律约束力。如果业主大会或业主委员会制定了关于共有部分使用的规则，三房客的行为违反了这些规则，其他业主可以通过业主大会或业主委员会要求三房客停止侵权行为。

此外，如果三房客的通信行为对建筑物的安全、其他业主的正常生活等造成了影响，比如产生了辐射、噪音等问题，还可能违反《中华人民共和国环境保护法》等相关法律法规。受到影响的业主可以要求三房客采取措施消除影响，如拆除通信设备、进行降噪处理等。如果三房客拒不改正，相关业主可以向环保部门等有关行政机关投诉，由行政机关依法进行处理。在这种情况下，原房东和二房东如果知道三房客的违规行为而未加以制止，也可能需要承担一定的责任。

综上所述，二房东擅自转租协议的效力取决于原房东是否追认，而三房客在屋顶通信的行为需要根据具体情况，依据相关法律规定进行处理，以维护各方的合法权益。