两个未成年发生了关系然后女生后悔了告男性强奸该如何处理？

首先要明确，强奸罪是指行为人违反我国刑法相关规定，违背被害人意愿，采用暴力、威胁、伤害或其他手段，强迫被害人进行性行为的犯罪。

我国《中华人民共和国刑法》第二百三十六条规定，以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。

对于这种情况，关键在于判断发生性关系时是否违背女生意愿。如果女生已满14周岁且是自愿发生关系，一般不构成强奸罪；但如果男生已满16周岁，明知对方是不满14周岁的幼女而与其发生性关系，不管其是否同意，均构成强奸罪。此外，男性已满14周岁不满16周岁偶尔与不满14周岁幼女发生性关系，情节轻微、未造成严重后果的，不认为是犯罪 。

如果女生指控男生强奸，侦查机关会收集充分证据来证实指控罪名是否属实。若不存在犯罪事实，而女生是故意捏造虚假事实指控男生，女生可能涉嫌诬告罪。若只是错误指控，最终男生被证实无罪后，男生有权向女生提起民事诉讼要求经济赔偿。