发票联丢失只有抵扣联该怎么办？

当遇到发票联丢失，仅留存抵扣联的情况时，不用过于着急，可按以下方式处理。

首先，依据《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十一条规定，使用发票的单位和个人应当妥善保管发票。发生发票丢失情形时，应当于发现丢失当日书面报告税务机关。所以，发现发票联丢失后，要第一时间书面报告给当地税务机关，详细说明丢失的情况，例如发票的开具时间、发票号码、涉及金额等信息。

其次，对于增值税专用发票，如果丢失了发票联但还有抵扣联，根据国家税务总局相关规定，可凭借抵扣联作为记账凭证，抵扣联复印件留存备查。也就是说，企业可以把抵扣联当作记账的依据来进行账务处理，同时要保存好抵扣联的复印件，以备后续税务机关检查等需要。

再者，对于普通发票，虽然没有明确统一的规定，但通常可以取得原开出单位盖有公章的证明，并注明原来发票的号码、金额和内容等，由经办单位会计机构负责人、会计主管人员和单位领导人批准后，代作原始凭证。

总之，发票联丢失后，按照相关规定及时报告和处理，一般不会对企业的正常财务和税务操作造成太大影响。但一定要严格按照规定程序办理，避免引发不必要的税务风险。