员工个税补税能否从公司扣除？

在探讨员工个税补税能否从公司扣除这个问题之前，我们需要先明确个人所得税的基本概念。个人所得税是对个人取得的各项应税所得征收的一种税，它的纳税主体是个人，也就是员工本人。这意味着缴纳个人所得税是员工的法定义务，而不是公司的义务。

依据《中华人民共和国个人所得税法》第九条规定，个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。公司作为扣缴义务人，只是有义务按照规定从员工的工资中预扣预缴个人所得税。简单来说，公司只是帮忙把员工该交的税扣下来交给税务机关，但最终承担纳税责任的还是员工。

一般情况下，公司不能自行从员工工资里扣除个税补税金额。若公司未经员工同意就直接扣除，这可能构成对员工工资权益的侵犯。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这里所说的克扣工资，就包含了没有合法依据扣除员工工资的情况。

不过，如果员工和公司之间有明确的书面约定，员工同意公司从工资中扣除个税补税金额，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣除是可以的。比如，在劳动合同或者补充协议中明确写明在出现个税补税情况时，员工授权公司从工资中扣除相应金额。但即便有这样的约定，公司也应当及时告知员工扣除的具体金额和原因，保障员工的知情权。

综上所述，在没有员工明确同意的书面约定时，公司不能随意从员工工资中扣除个税补税金额；有约定且不违法的情况下，公司可以按照约定扣除。