企业年金扣除个人所得税时要减去扣除部分吗？

企业年金是企业及其职工在依法参加基本养老保险的基础上，自主建立的补充养老保险制度。在个人所得税的处理上，是要减去扣除部分的。

根据《财政部 人力资源社会保障部 国家税务总局关于企业年金 职业年金个人所得税有关问题的通知》（财税〔2013〕103号）规定，个人根据国家有关政策规定缴付的年金个人缴费部分，在不超过本人缴费工资计税基数的4%从个人当期的应纳税所得额中扣除。

具体来说，企业年金个人缴费工资计税基数为本人上一年度月平均工资。月平均工资按国家统计局规定列入工资总额统计的项目计算。月平均工资超过职工工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资300%以上的部分，不计入个人缴费工资计税基数。

举个例子，假设小李上一年度月平均工资为8000元，当地上一年度职工月平均工资为3000元，300%就是9000元，小李的工资未超过这个标准，那么他的企业年金个人缴费工资计税基数就是8000元。按照4%的扣除标准，每月可以扣除320元（8000×4%），在计算个人所得税时，这320元是要从他当月的应纳税所得额中减去的。这样就降低了应纳税所得额，从而减少了个人所得税的缴纳金额。