农村住房的房产证归哪个部门管理？

农村住房房产证的管理涉及多个环节，不同环节由不同部门负责。

在办理房产证的前期，首先是宅基地使用权及房屋所有权的确权登记。根据《不动产登记暂行条例》，不动产登记由不动产所在地的县级人民政府不动产登记机构办理。这意味着，农村住房房产证办理的登记工作主要由当地的县级不动产登记部门负责。县级不动产登记部门会对申请人提交的材料进行审核，比如申请人的身份证明、宅基地使用证明、房屋符合规划或建设的相关材料等。审核通过后，才会进行登记造册，并核发不动产权证书。

而在住房建设的规划审批环节，通常是由乡镇人民政府负责。在农村建房，需要先向乡镇人民政府提出申请，乡镇人民政府会依据相关的城乡规划和土地管理规定，对建房申请进行审批，确定建房是否符合规划要求等。只有获得了乡镇人民政府的相关审批文件，才具备进一步办理房产证的基础条件。

另外，土地管理方面，县级以上人民政府土地行政主管部门负责本行政区域内的土地管理和监督工作。农村住房占用的宅基地属于集体土地，土地行政主管部门会对宅基地的使用情况进行监管，确保符合土地用途等相关规定。

所以，农村住房房产证的办理，既需要和当地的县级不动产登记部门打交道进行登记发证，也要在前期建设规划审批时和乡镇人民政府沟通，并且要遵循土地行政主管部门关于土地使用的规定。