上海某知识产权代理有限公司起诉上海某网络科技有限公司侵犯权益，法律上会如何处理？

在知识产权侵权案件中，当原告上海某知识产权代理有限公司起诉被告上海某网络科技有限公司侵犯权益时，法律的处理通常会经历多个步骤。

首先是关于侵权行为的认定。知识产权涵盖了商标权、专利权、著作权等多种权利。以著作权为例，根据《中华人民共和国著作权法》，著作权人对其作品享有复制权、发行权、信息网络传播权等权利。如果被告未经许可，擅自复制、传播原告享有著作权的作品，就可能构成著作权侵权。对于商标权，《中华人民共和国商标法》规定，未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标，或者在类似商品上使用与其注册商标近似的商标，容易导致混淆的，属于侵犯注册商标专用权的行为。

一旦认定被告存在侵权行为，接下来就涉及到责任的承担。根据《中华人民共和国民法典》第一千一百八十五条规定，故意侵害他人知识产权，情节严重的，被侵权人有权请求相应的惩罚性赔偿。一般来说，侵权人需要承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。赔偿数额的确定是一个关键问题。依据相关法律，赔偿数额按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以计算的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定。权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该知识产权许可使用费的倍数合理确定。对故意侵犯知识产权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。权利人的损失、侵权人获得的利益和知识产权许可使用费均难以确定的，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予五百元以上五百万元以下的赔偿。

在诉讼过程中，证据的收集至关重要。原告需要提供充分的证据来证明自己拥有相关知识产权以及被告的侵权行为。例如，对于著作权侵权，原告需要提供作品的创作底稿、发表证明等；对于商标权侵权，需要提供商标注册证书等。同时，被告也有权利进行抗辩，如果被告能够证明自己的使用行为是合理使用或者有合法来源等，可能会减轻或免除其侵权责任。

如果原告胜诉，除了获得经济赔偿外，还可以要求被告停止侵权行为，比如停止使用侵权的商标、停止传播侵权的作品等。如果败诉，原告可能需要承担自己的诉讼费用，并且不能获得赔偿。不过，原告也可以根据具体情况，考虑是否有新的证据或理由进行上诉。

总之，知识产权侵权案件的处理需要综合考虑多方面因素，依据相关法律规定进行公正的裁决。