公司注销时留抵的进项税额该如何处理？

当公司注销时，留抵的进项税额处理问题需要依据相关法律规定来确定。首先，我们来解释一下留抵进项税额。留抵进项税额是指企业当期的增值税进项税额大于销项税额时，出现的差额部分，这部分税额可以留到下期继续抵扣销项税额。

根据《财政部 国家税务总局关于增值税若干政策的通知》（财税〔2005〕165号）第六条规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。这就意味着，在公司注销的情况下，留抵的进项税额通常是不能申请退税的。

这背后的原理是，增值税是对商品和服务流转过程中的增值部分征税。留抵进项税额本质上是企业在采购环节预先支付的增值税，原本是期待在后续销售环节通过销项税额来进行抵扣。但当公司注销时，后续的销售环节不再存在，也就无法实现正常的抵扣流程，所以按照规定不予退税。

不过，虽然留抵进项税额不能退税，但在企业注销清算过程中，需要对所有的资产、负债等进行清理。留抵进项税额可以作为企业的一项资产损失来考虑，在计算企业所得税时按照相关规定进行税前扣除。企业应按照《企业资产损失所得税税前扣除管理办法》的规定，准备好相关的证据资料，向税务机关申报资产损失扣除。这样可以在一定程度上减少企业的税务负担。