发票被税务查出有问题该怎么办？

当发票被税务查出有问题时，首先要明确这其中涉及到的法律概念。发票是在购销商品、提供或者接受服务以及从事其他经营活动中，开具、收取的收付款凭证。税务机关对发票的管理和检查是保障税收征管秩序的重要工作。

若发票被查出问题，依据《中华人民共和国发票管理办法》，不同的问题有不同的处理方式。如果是未按照规定开具发票，比如应当开具而未开具发票，或者未按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性开具发票等情况，由税务机关责令改正，可以处1万元以下的罚款；有违法所得的予以没收。

要是涉及到虚开发票，这是更为严重的问题。虚开发票是指为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。根据规定，虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

面对发票被查出问题，企业或个人应该积极配合税务机关的检查工作。主动提供相关的合同、账目、凭证等资料，如实说明发票的来源、使用情况等。如果确实存在问题，要诚恳地承认错误，表明愿意接受处罚和整改的态度。

对于可以补救的情况，比如发票开具错误等，应按照税务机关的要求及时进行更正和重新开具。并且要对企业内部的发票管理制度进行完善，加强对财务人员的培训，避免类似问题再次发生。如果对税务机关的处理结果有异议，也可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼来维护自己的合法权益。